|
Lääketieteellisen fysiikan ja tekniikan yhdistys (LFTY)
Finnish Society for Medical Physics and Medical Engineering
In English
|
LFT-päivä 7.2.2008, Tietotalo, Oulun yliopisto
Posterikilpailuun osallistuneet
1. Alamäki Heikki, Oulun yliopisto
Potilaan EKG:n, hengitustaajuuden, asennon ja lämpötilan mittaaminen anturivyöllä sekä signaalien langaton
Zigbee-tiedonsiirto.
2. Dogu Baran Aydogan, Tampereen teknillinen yliopisto
Texture Analysis of Biomedical Images Based on Dual-Tree Complex Wavelet Transform.
3. Bragge Timo, Kuopion yliopisto
Pääkomponenttipohjainen signaalien ennustaminen liikeanalyysissa.
4. Dabek Juhani, Teknillinen korkeakoulu
EKG-kartat sydäniskemian havainnoinnissa.
5. Hakala Heidi, Tampereen teknillinen yliopisto
Kliinisen laboratorion analysaattoriliitäntöjen valvontajärjestelmä.
6. Harrison Lara, Tampereen teknillinen yliopisto
MRI texture analysis of non-Hodgkin lymphoma.
7. Isojärvi Henri, Oulun yliopisto
Sokeritasapainon häiriintymisen ja fyysisen kunnon vaikutukset ääreishermoston
toimintaan ylipainoisilla ihmisillä.
8. Kailanto Harri, Tampereen teknillinen yliopisto
Biosignaalien analysointi mobiilissa ympäristössä.
9. Kallioniemi Antti, Tampereen teknillinen yliopisto
Microtomography based modeling of acoustic properties of cancellous bone.
10. Kangas Maarit, Oulun yliopisto
Kaatumisen tunnistaminen kiihtyvyyssignaalista.
11. Kapucu Fikret Emre, Tampereen teknillinen yliopisto
Phase Coupling in EEG Burst Suppression during Propofol Anesthesia.
12. Karjalainen Janne, Oulun Yliopisto
Methodology for use in ultrasound backscatter-based osteoporosis diagnostics.
13. Laurila Maija, Tampereen teknillinen yliopisto
MRI relaxometry of the human brain in vivo at 1.5 T, 3 T, and 4 T.
14. Lehtonen Henna-Maria, Turun yliopisto
Marjojen flavonoidien analysointi plasmasta HPLC-SI-MSMS-menetelmällä.
15. Lipponen Jukka, Kuopion yliopisto
Kaulavaltimon ultraäänikuvien sekä EKG- ja verenpainesignaalin ajastettu
analyysi.
16. Määttä Mikko, Oulun yliopisto
Guided wave ultrasound in the assessment of osteoporosis in elderly women.
17. Nissi Mikko, Kuopion yliopisto
Nivelruston kollageenisäikeistön vaikutus T2-relaksaatioaikaan.
18. Näsi Tiina, Teknillinen korkeakoulu
Verenkierrollisten ja sähköisten näköherätevasteiden kytkennän mallinnus samanaikaisista
NIRS- ja EEG-mittauksista.
19. Nöjd Niina, Tampereen teknillinen yliopisto
Optimaaliset elektrodipaikat kasvojen EMG- ja EOG- mittauksiin.
20. Pulkkinen Aki, Kuopion Yliopisto
Resolution study of transcranial optoacoustic imaging of veins - a modelling
study.
21. Sliz Rafal, Oulun Yliopisto
Integration of zigbee and rfid technologies into hospital environment.
22. Varanka Matti, Oulun yliopisto
Estimating running performance from physiological data.
23. Virtanen Jaako, Teknillinen korkeakoulu
Near-infrared spectroscopy in measuring changes of cerebral haemoglobin concentrations
during natural sleep.
Postereiden abstraktit
Potilaan EKG:n, hengitustaajuuden, asennon ja lämpötilan mittaaminen anturivyöllä sekä signaalien langaton
Zigbee-tiedonsiirto
Alamäki Heikki, Oulun yliopisto
Langattoman seurannan mahdollisuuksia sairaalassa on haettu muun muassa WILHO (Wireless Hospital)-hankkeen
esipilotointiprojektissa, joka suoritettiin Oulun alueen sairaaloissa. Projektin tulosten perusteella päätettiin kehittää
laite, joka kykenisi mittaamaan useita parametrejä samanaikaisesti ja pystyisi lähettämään mittaustulokset
langattomasti. Näiden vaatimusten pohjalta muotoutuivat vaatimukset tälle työlle. Laite tulisi olla puettava vyö ja sen
tulisi kyetä mittaamaan EKG:tä (Elektrokardiogrammi), hengitystaajuutta, asentoa ja ihon lämpötilaa sekä lähettämään
mittausdata langattomasti käyttäen ZigBee-radiotekniikkaa. Kommunikointi tulisi toteuttaa suunniteltavan protokollan
mukaisesti, jotta tiedonsiirrosta saataisiin luotettava ja turvallinen.
Laitteessa päätettiin käyttää Polar Electro Oy:n kangaselektrodivyötä ja rakentaa oma elektroniikka ja kotelointi siihen
sopivaksi. Vyön kangaselektrodeilla saadaan johdettua heikot EKG-signaalit kehosta piirilevylle
vahvistettavaksi. Hengitystaajuuden mittaaminen toteutettiin käyttämällä kolmiakselista kiihtyvyysanturia. Hengitys
saadaan mitattua kiihtyvyysanturilta hengityksen ja pallean aiheuttaman liikkeen ja kallistumisen perusteella. Asennon
mittaaminen toteutettiin myös kiihtyvyysanturilla sen ulostulojännitteen DC-tason perusteella. Lämpötilan mittaamiseen
iholta käytettiin NTC-tyyppistä resistanssianturia, joka integroitiin vyöhön. Anturivyön analogia-elektroniikka
suunniteltiin mahdollisimman vähän tilaa vieväksi, vähävirtaiseksi ja siinä hyödynnettiin markkinoilla tarjolla olevista
komponenteista kuhunkin kytkentään parhaiten soveltuvia komponentteja. Langaton kommunikointi toteutettiin
N120-moduulilla, joka sisältää muun muassa 8051 mikrokontrollerin sekä IEEE (Institute of Electrical and Electronics
Engineers) 802.15.4-standardin mukaisen ZigBee-lähetin/vastaanottimen. Moduulin ja tiedonsiirtoprotokollan ohjelmoiminen
toteutettiin Linux-ympäristössä laiteläheistä C-ohjelmointikieltä hyväksikäyttäen.
Vyön testaukset toteutettiin kaksivaiheisina langallisina ja langattomina testauksina. Langallisissa testauksissa
keskityttiin testaamaan signaalien laatua ja kytkentöjen onnistumista. Langattomat testaukset sisälsivät
ohjelmistotestausta, signaalien laadun havainnointia, kiihtyvyysanturisignaalien vahvistuksen tarpeellisuuden testausta
ja lämpötila-anturitestauksia. Sekä langallisia että langattomia testauksia varten kehitettiin LabVIEW:lla omat ohjelmat
tulostamaan signaalit graafisesti tietokoneen näytölle. Testituloksista voidaan päätellä langattomuuden parantavan
signaalien laatua. Tämä näkyy erityisesti EKG- ja kiihtyvyysanturisignaalien laadussa. Hengitysmittaukset havaittiin
pystyttävän tekemään vahvistamattomien kiihtyvyysanturisignaalien perusteella. Lisäksi havaittiin että hengitys pystytään
mittaamaan sekä pallean aiheuttaman kiihtyvyyden että kulman muutosten perusteella. Asento -ja lämpötilamittaukset
saatiin toteutettua vaatimusmäärittelyn mukaisilla vaatimuksilla, jotka olivat yhden asteen tarkkuus kulmamittauksissa
X-, Y- ja Z-akselilla ja 0,1 asteen tarkkuus lämpötilamittauksissa.
Anturivyö saatiin onnistuneesti toteutettua lähettämään langatonta mittausdataa. Langattomuus parantaa signaalien laatua,
koska häiriön kytkeytymismahdollisuus pienenee. Suurin hyöty langattomuudesta saadaan kuitenkin sen mobiilisuuden
ansiosta. Langattoman anturivyön tekeminen ZigBee-tekniikalla on merkittävä saavutus, sillä vastaavaa tuotetta ei ole
olemassa vielä markkinoilla. Suuri määrä anturivyöstä saatavaa mittausdataa sekä uudella ZigBee-tekniikalla varustettu
langaton tiedonsiirto tekevätkin vyöstä merkittävän sovelluksen langattoman sairaalan tarpeisiin.
Texture Analysis of Biomedical Images Based on Dual-Tree Complex Wavelet Transform
Dogu Baran Aydogan, Tampereen teknillinen yliopisto
Image textures do not have a strict mathematical definition even though they carry a rich source of visual information
about the nature and three dimensional shapes of objects. Textures can be regarded as complex visual patterns composed of
entities or sub-patterns that have characteristic brightness, color, slope or size. Texture analysis and synthesis are
the two important fields of image processing which have been studied since the later part of 1960’s. In biomedical image
processing, texture analysis is used in several applications from tracking structural changes of a tissue to segmentation
of anatomical structures.
The core of texture analysis is the extraction of texture features. Among several approaches that have been studied in
the literature, a transform based method is chosen for texture feature extraction in this thesis. The transform that has
been used, is the dual-tree complex wavelet transform (DT-CWT) which is a recent wavelet method that has proved to give
better results for texture analysis applications compared to previously suggested signal processing methods. The goal of
this work is to introduce DT-CWT based texture analysis methods for biomedical images. These methods can be used both for
2-D and 3-D processing of biomedical images for several applications. This thesis explains three of them which are
classification of tissues, segmentation of anatomical structures and estimation of volume texture orientations.
Methods that are proposed in this study are based on the energies of sub-bands of 2-D DT-CWT decomposition for 2-D
images. A similar process is followed for 3-D data; however, instead of using 3-D DT-CWT, once again 2-D DT-CWT is used
to increase directional selectivity. In order to use 2-D DT-CWT in 3-D volumes, several 2-D planar slices of 3-D data
are calculated. 6th order B-spline interpolators are used during this work to increase the quality of the planar
slices. After the methods are explained, their performances are tested and compared based on three applications written
above.
The methods are tested on artificial 2-D and 3-D textures as well as on T1 and T2 weighted magnetic resonance images
(MRI). The applications based on these methods give promising results. It is demonstrated that a simple classifier that
uses DT-CWT based texture features can separate bones from four other different tissues. It is also shown that these
features can be used for segmenting textured regions such as cerebellum in brain images; in addition to these 3-D
orientations of volume textures can be calculated which is demonstrated by estimating muscle fiber orientations.
With this work, it is verified that DT-CWT is an appropriate choice for texture analysis of both 2-D and 3-D biomedical
images. A part of this work that is related to orientation estimation of volume textures is send to be published in IEEE
Transactions of Image Processing. Such applications can be extended for further clinical uses. Two of currently planned
works are classification of tumors and detection of bone fractures based on texture orientation.
Pääkomponenttipohjainen signaalien ennustaminen liikeanalyysissa
Bragge Timo, Kuopion yliopisto
Työn tavoitteena oli kehittää menetelmä, jolla voidaan ennustaa liikeanalyysisovelluksissa käytettäviä signaaleja
inertia-antureilla laboratorion ulkopuolella. Liikeanalyysillä tarkoitetaan ihmisen liikkeiden mittaamista ja
mallintamista. Liikeanalyysiin käytetään yleensä kamerapohjaista järjestelmää, ja mittauksissa käytetään usein lisäksi
voimalevyjä. Perinteisesti näitä mittauksia on voinut tehdä vain tarkoitukseen suunnitelluissa laboratorioissa. Ihmisen
liikkeitä voidaan mitata myös inertia-antureiden avulla, joita ovat esimerkiksi kolmiakseliset kiihtyvyysanturit ja
gyroskoopit. Liikeanalyysilaboratoriot ovat kalliita ja ovat sidoksissa tiettyyn tilaan, joten inertia-anturipohjaisille
liikeanalyysimenetelmille on paljon sovelluskohteita.
Tässä työssä kehitettiin pääkomponenttianalyysiin (PCA) perustuva menetelmä signaalin ennustukseen ja rekonstruointiin,
jota voi hyödyntää liikeanalyysisovelluksissa laboratorion ulkopuolella. Menetelmän avulla muodostettiin fenomenologinen
malli, jonka avulla ennustettiin kiihtyvyysanturimittausten avulla reaktiovoiman resultanttia. Kehitetyn menetelmän
avulla pyrittiin siis ennustamaan voimalevymittauksia laboratorion ulkopuolella tehtyjen mittausten avulla, eli
tavoitteena oli estimoida, millaisia reaktiovoimasignaalit olisivat olleet, jos ne olisi pystytty mittaamaan.
Menetelmää testattiin simulaatioin ja mittauksin. Simulaatioiden perusteella voidaan todeta, että ennustusmenetelmä
toimii, kunhan ominaisvektorien määrä valitaan sopivasti. Reaalidatan tapauksessa ennustettiin reaktiovoimamittauksen
resultanttisignaali kiihtyvyysmittausten avulla ensimmäisen 200 ms ajalta askelkontaktin alusta normaalissa
kävelyssä. Kantaiskupiikin ennustaminen onnistui hyvin, kaksoistukivaiheen aikana ennustusvirheet kasvoivat.
PCA:han perustuvan signaaliregressiomenetelmän avulla voidaan mallintaa monimutkaisiakin ilmiöitä ilman ilmiöiden tarkkaa
fysikaalista mallintamista. Menetelmää voi periaatteessa soveltaa minkälaisten tahansa toisistaan jollain tuntemattomalla
tavalla riippuvien suureiden ennustamiseen.
EKG-kartat sydäniskemian havainnoinnissa
Dabek Juhani, Teknillinen korkeakoulu
Yksi käytetyimmistä ja tarkimmista kajoamattomista menetelmistä sydämen toiminnan arviointiin on elektrokardiografia
(EKG). Länsimaissa yleisin kuolinsyy on iskeemiset sydänsairaudet, joilla tarkoitetaan sydämen oman verenkierron
estymistä sepelvaltimoissa. Tässä työssä tutkittiin sydäniskemiaa EKG-kartoitusmittauksista johdettujen karttojen
avulla. Iskemian havaitsemiseen, paikallistamiseen ja kvantifiointiin tarvitaan uusia analysointimenetelmiä.
EKG-analyysiin kehitettiin 4 uutta tapaa: tyypillisen kartan etsintä; sydämen keskipistevektori (SKV); kartan
eksentrisyys; ja kartan sirpaleisuus. Näistä ensimmäisellä samantyyppisten karttojen joukosta voidaan valita yksi
edustava tarkasteluun. Muissa lähtökohtana on kartan gradientin laskenta kussakin rintakehän diskretointipisteessä. SKV:n
tulos on vektori, eksentrisyyden skalaari ja sirpaleisuuden histogrammi. Iskemian paikantamiseen kehitettiin myös
bayesilainen luokittelumenetelmä. EKG-kartoista käytiin läpi kaikki 3 elektrodin kombinaatiot, ja parhaiten 3
sepelvaltimoryhmään luokittelevat kombinaatiot löydettiin. Tutkimuksissa käytettiin pallolaajennusaineiston
ST60-amplitudin karttoja. Amplitudi mitataan EKG-käyrästä 60 ms QRS-kompleksin jälkeen ST-segmentissä.
Tyypillisen kartan etsinnän todettiin toimivan hyvin, ja se on sovellettavissa muuhunkin vektorimuotoiseen
mittausaineistoon. Tämän diplomityön ohessa kehitettiin myös paljon iskemia-aineiston mittaustulosten läpikäymiseen
tarkoitettua Matlab-ohjelmistoa. Laskettuja EKG-karttoja oli noin 100 ja näillä tutkittuja parametreja 47. SKV oli paras,
jopa dipolia parempi iskemian tunnistaja T-aaltoamplitudikartoilla (area under ROC curve, eli AUC = 0,839). Kun
iskemiasta kehittyneen infarktin vakavuutta mitattiin CKMB-entsyymin konsentraatiolla veressä, SKV oli tutkituista
parametreista paras (korrelaatio -0,602; N = 79). Eksentrisyys ja sirpaleisuus eivät toimineet iskemiamäärityksissä yhtä
hyvin. Bayesilaisella luokittelulla pallolaajennusaineistossa havaittiin, että perinteisen 12-kytkentä-EKG:n
rintakytkentöjen lisäksi arvokasta tietoa saadaan elektrodista selässä.
Menetelmä tyypillisen kartan etsimiseen vähentää asiantuntijan työmäärää. SKV on vektori, kuten perinteisesti sovitettu
dipolikin, mutta se saadaan informaatioteoreettisella tarkastelulla. Sen luokittelukyky on osoittautunut dipolien
vertaiseksi. Jos taas iskemian paikantamiseen on käytettävissä vain kolme elektrodia, voidaan suositella käytettäväksi
kahta elektrodia sydämen etupuolella ja yhtä selässä. Kehitetyillä menetelmillä voidaan entistä paremmin havaita
sydäniskemia, paikallistaa se ja kvantifioida mahdollisen tuoreen infarktin suuruutta. Menetelmät ovat sovellettavissa
kliiniseen työhön - näin voidaan tehostaa lääkärin työskentelyä.
Kliinisen laboratorion analysaattoriliitäntöjen valvontajärjestelmä
Hakala Heidi, Tampereen teknillinen yliopisto
Abstraktia ei julkaista tekijän toivomuksesta.
MRI texture analysis of non-Hodgkin lymphoma
Harrison Lara, Tampereen teknillinen yliopisto
Abstraktia ei julkaista tekijän toivomuksesta.
Sokeritasapainon häiriintymisen ja fyysisen kunnon vaikutukset ääreishermoston toimintaan ylipainoisilla ihmisillä
Isojärvi Henri, Oulun yliopisto
Tässä työssä tutkittiin, miten sokeritasapainon häiriintyminen sekä fyysinen kunto vaikuttavat ääreishermoston toimintaan
ylipainoisilla ihmisillä. Lisäksi tutkimuksen kohteena oli mediaalisen plantaarihermon käyttökelpoisuus hermovaurion
indikaattorina.
Tutkimukseen osallistui 47 työikäistä ylipainoista henkilöä. Testihenkilöiltä mitattiin peroneushermon motoriset
hermovasteet, johtonopeudet (NCV) sekä F-aallot. Lisäksi testihenkilöiltä mitattiin sensoriset hermovasteet ja
johtonopeudet suralis- ja radialishermoista sekä mediaalisesta plantaarihermosta. Heidän sokeri- ja insuliiniarvonsa
75g-sokerirasituskokeesta olivat tiedossa viimeisen 2 - 3 vuoden ajalta (0 kk, 3 kk, 9 kk, 24 kk, 36 kk). Alkoholinkäyttö
ja tupakointi olivat tiedossa 2 - 3 vuotta sitten suoritetun ravintokyselyn ja ruokapäiväkirjan kautta. Testihenkilöiltä
oli määritetty suhteellinen maksimaalinen hapenottokyky polkupyöräergometritestillä samoihin aikoihin kuin neurografia,
eli keväällä 2007.
Askeltavan regressioanalyysin mukaan aterian jälkeisellä insuliinilla (2h-arvo) sekä aterian jälkeisen insuliiniarvojen
keskiarvolla on merkitseviä positiivisia yhteyksiä neurografisiin muuttujiin, jokaisessa mitatussa
hermossa. Suhteellisella maksimaalisella hapenotolla (VO2max) löytyi myös merkitseviä positiivisia yhteyksiä
neurografisiin muuttujiin, lähinnä kuitenkin vain motorisen hermon muuttujiin. Normaalista poikkeavia tuloksia
neurografiassa löydettiin neljältä henkilöltä. Kolmella heistä oli heikentyneitä vasteita muissakin kuin mediaalisessa
plantaarihermossa. Yhdellä heistä oli heikentynyt vaste ainoastaan mediaalisessa plantaarihermossa.
Aterian jälkeisellä runsaalla insuliinipitoisuudella vaikuttaisi olevan jonkinasteinen parantava vaikutus ääreishermoston
toimintaan. Todennäköisesti tämä vaikutus syntyy siitä, että glukoosin metabolian kompensointiin tarkoitettua insuliinia
jää normaalia enemmän yli ja ylimääräinen insuliini kulkeutuu hermokudoksiin aiheuttaen edellä mainittuja positiivisia
vaikutuksia. Tulostemme perusteella voimme todeta, että kohonnut veren insuliinipitoisuus on yksi varteenotettavista
selittäjistä sille, miksi lihavilla on löydetty lyhyempiä latenssiaikoja ja parempia hermonjohtonopeuksia kuin
normaalipainoisilla. Fyysisellä kunnolla vaikuttaisi myös olevan positiivinen vaikutus ääreishermoston
toimintaan. Tulostemme perusteella mediaalinen plantaarihermo voi olla yhtä käyttökelpoinen hermovaurion indikaattori
kuin muut rutiinikäytössä olevat hermot. Toisaalta mediaalisen plantaarihermon heikkoutena on se, että siihen vaikuttavat
merkittävästi ikä ja paino, molemmat negatiivisesti.
Biosignaalien analysointi mobiilissa ympäristössä
Kailanto Harri, Tampereen teknillinen yliopisto
Tässä diplomityössä tarkastellaan lääketieteellisten signaalien käsittelyä langattomassa, mobiilissa ympäristössä
keskittyen erityisesti elektrokardiografiaan (EKG) sekä kuvataan matkapuhelimeen suunniteltu ja toteutettu
EKG-sovellus. Työ on tehty osana Uusi teknologia terveys-, kuntoutus- ja turvallisuuspalveluiden yksilöllisessä
toteuttamisessa (UUTE) -projektia. Projektin pyrkimyksenä on toteuttaa niin sanottu "älykoti matkalaukussa" -konsepti,
jossa täysin mobiileilla tai helposti kotiin asennettavilla järjestelmillä voitaisiin toteuttaa terveyteen, kotiin tai
asukkaan turvallisuuteen liittyviä palveluita.
Tehty työ jakaantuu kahteen osaan, joista ensimmäinen on katsaus jo kehitettyihin langattomiin biosignaalien
mittalaitteisiin, niiden datankäsittelyominaisuuksiin ja käytettyihin siirtomenetelmiin. Katsauksen yhteydessä
tarkastellaan datan käsittelyn mahdollisuuksia ja ongelmia virrankulutuksen kannalta. Työn jälkimmäinen osa käsittelee
suunniteltua ja toteutettua EKG:n siirto- ja analyysisovellusta Nokia 6681 matkapuhelimeen. Sovellus on osa
UUTE-projektissa kehitettyä järjestelmää, jolla esimerkiksi rytmihäiriöpotilaiden tilaa voidaan monitoroida koti-oloissa
ja mittausdataa voidaan tarvittaessa lähettää lääkärin käyttöön.
Materiaali katsaukseen etsittiin pääosin käyttäen internetissä olevia yleisiä hakukoneita sekä tieteellisten
verkkolehtien palveluja. Katsauksessa keskityttiin sairaalan ulkopuolella käytettäviin laitteisiin, joita on tarkoitus
käyttää ilman lääketieteellisen henkilökunnan jatkuvaa läsnäoloa. Puhelimeen tehty sovellus toteutettiin Java Platform,
Micro Editionilla. Se vastaanottaa EKGmittausdataa erityiseltä mittalaitteelta Bluetooth-tekniikan avulla ja tallettaa
sitä jatkuvasti muistikortille. Vastaanotetusta mittausdatasta sovellus määrittää mitattavan henkilön sykkeen ja tekee
tämän perusteella analyysin mahdollisesta rytmihäiriöstä. Tunnistettuaan rytmihäiriön sovellus siirtää osan
mittausdatasta palvelimelle myöhempää käyttöä varten.
Katsaus osoittaa, että nykyisissä mittalaitteissa yleisin langattomasti mitattu biosignaali on elektrokardiogrammi
(EKG). Yksi syy tälle on, että EKG:ta mitataan usein pitkäaikaisesti ja langattomuudesta saatu hyöty on näin suurempi
kuin esimerkiksi verenpainemittauksessa, joka tyypillisesti kestää noin minuutin. Langattomassa tiedonsiirrossa
puolestaan erilaiset radiotekniikat ovat selvästi useimmin käytössä. Näistä erityisesti Bluetooth-teknologialla on vahva
jalansija uusimmissa mittalaitteissa.
Katsauksen tuloksista nähdään, että langattomissa mittalaitejärjestelmissä ei toistaiseksi tehdä juurikaan automaattista
diagnoosia mittausdatasta. Tähän on nykytekniikalla mahdollisuuksia mutta ongelmia aiheuttaa etenkin datan tallennuksen
ja analysoinnin tehonkulutus. Matkapuhelimeen toteutettu Java-sovellus puolestaan osoitti, että nykyiset älypuhelimet
ovat hyvinkin kykeneviä signaalinkäsittelyyn ja hyvien verkottumisominaisuuksiensa myötä ovat siten potentiaalinen osa
tulevaisuuden langattomia biosignaalien mittausjärjestelmiä.
Microtomography based modeling of acoustic properties of cancellous bone
Kallioniemi Antti, Tampereen teknillinen yliopisto
Osteoporosis is a common socio-economically important metabolic bone disease in which the bone mineral density and
microstructure are disrupted. Quantitative ultrasound is a relatively new method for diagnosing osteoporosis but the
effect of bone marrow on ultrasound propagation, i.e. attenuation and scattering, is still poorly characterized. The
present study investigates the propagation of ultrasound and the role of bone marrow by the means of
microtomography-based three-dimensional finite difference time domain (FDTD) modeling.
Cylindrical samples (n=11, d=16mm, h=8mm) were prepared from three anatomical sites of human cadaver knees. Structure and
morphology of the samples were analyzed with a highresolution microtomography system and bone mineral density was
estimated with dual-energy X-ray absortiometry. Wave 3000 Pro 2.2 software was used for three-dimensional FDTD
simulations. FDTD models were created using segmented micro-CT images of the individual samples. The simulations were
repeated before and after substitution of bone marrow with water.
The voxel size of the simulation mesh was found to have a significant effect on the fine structure of the calcified
matrix and, thus, on the modeling results. In the FDTD model, substitution of bone marrow with water resulted in a
decrease in attenuation (p<0.01) and an increase in the speed of sound (p<0.01). This was expected as ultrasound
attenuation in bone marrow is greater, and the speed of sound lower, than in water. Moreover, reflection from the surface
of the sample and backscatter from the internal structures increased (p<0.01) along with the removal of bone marrow. The
contribution of bone marrow on acoustic properties of the samples was found to be stronger (p<0.01) in samples with low
bone volume fraction, probably due to the larger volume of substituted material.
Current simulations were in agreement with earlier experimental investigations which suggest that inter-individual
differences in the composition of marrow may have significant effect on the measured ultrasound parameters, especially
when investigating osteoporotic low density bone. Also the non-linear relationship between attenuation and bone volume
fraction has been reported experimentally and theoretically.
Kaatumisen tunnistaminen kiihtyvyyssignaalista
Kangas Maarit, Oulun yliopisto
Keskimäärin joka kolmas ikääntynyt (yli 65-vuotias) henkilö kaatuu vuosittain. Kaatuminen ja sen pelko vaikuttavat
voimakkaasti ikääntyvän väestön elämänlaatuun. Automaattisilla kaatumishälyttimillä voidaan varmistaa avun saapuminen
paikalle myös tapauksissa, joissa kaatuja ei itse kykene hälyttämään apua. Tämän tutkimuksen tavoitteena oli kehittää
luotettavia automaattisia menetelmiä kaatumisen tunnistamiseen käyttäen kehoon kiinnitettäviä kiihtyvyysantureita.
Tutkimuksessa mitattiin kiihtyvyyssignaalia päähän, vyötärölle ja ranteeseen kiinnitetyillä kolmisuuntaisilla
kiihtyvyysantureilla. Vapaaehtoiset testihenkilöt suorittivat testikaatumisia (56-59 näytettä/kiinnityspaikka) ja
päivittäisiä toimintoja (12- 31 näytettä/kiinnityspaikka) laboratorio-olosuhteissa. Kiihtyvyyssignaalista määritettiin
erilaisille parametreille, kuten summavektori ja nopeus, raja-arvoja, joilla päivittäiset toiminnot ja kaatuminen voidaan
erottaa toisistaan. Tutkimuksessa kehitettiin uusia kaatumisen tunnistavia algoritmeja ja testattiin niiden herkkyyttä ja
tarkkuutta eri mittauspaikoissa. Algoritmit perustuvat kaatumisen eri vaiheiden (alun, törmäyksen ja loppuasennon)
tunnistamiseen.
Tulosten mukaan kaatumiset tunnistetaan parhaiten vyötäröltä ja pään alueelta mitatusta signaalista. Algoritmi, joka
perustuu törmäyksen ja loppuasennon tunnistamiseen, tunnistaa kaatumiset tehokkaimmin 97-98 % herkkyydellä ja 100 %
tarkkuudella. Vaikka pään alueelle kiinnitetyn kiihtyvyysanturin herkkyys on joissakin tapauksissa jopa parempi kuin
vyötärölle kiinnitetyn, vaatii pää laitteen kiinnityspaikkana enemmän suunnittelua. Ranteeseen kiinnitetty
kiihtyvyysanturi soveltuu huomattavasti edellisiä heikommin kaatumisen tunnistamiseen.
Lopputuloksena esitämme vyötärölle kiinnitettävän kolmisuuntaisen kiihtyvyysanturin käyttöä kaatumisen automaattiseen
tunnistamiseen. Kaatumisen tunnistava algoritmi perustuu yksinkertaisimmillaan kaatumiseen liittyvän törmäyksen ja
asennon tunnistamiseen.
Phase Coupling in EEG Burst Suppression during Propofol Anesthesia
Kapucu Fikret Emre, Tampereen teknillinen yliopisto
This work analyzes the quadratic phase coupling between EEG rhythms during burst suppression period of propofol
anesthesia. The main goal is to specify the phase relation between different EEG rhythms and investigate for possible
systematic behavior. In order to do so, the presented work focuses on the detection of quadratic phase coupling (QPC) by
means of bispectral analysis.
The proposed method also includes the data acquisition criteria and classification of EEG bursts into two groups
regarding to their physiological occurrence which are electrically stimulated and spontaneously occurred
bursts. Quadratic phase coupling is analyzed for these two burst groups.
The study indicates that frequencies of the dominant components of the bursts vary, so the detection of QPC is
practically not as simple as detecting synchrony between couples of well defined rhythms. Consequently, each burst
pattern presents distinct phase coupling properties. Average bicoherence results from different burst groups also from
different channels demonstrate inadequate results for an interpretation. Bispectral analysis is an impressive method to
detect well defined signal components with certain phase coupling however in more complex situations the results are very
difficult to interpret.
Methodology for use in ultrasound backscatter-based osteoporosis diagnostics
Karjalainen Janne, Oulun Yliopisto
Introduction: Osteoporosis is a disease characterized by loss of bone mass and a deterioration of tissue structure,
exposing individuals with this condition to increased risk of fractures. The initial changes in density and structure are
generally understood to occur in trabecular bone. However, the amount of compact bone is also severely diminished in
osteoporosis and may be detected as thinning of cortical layer in the shafts of long bones. The goal of this thesis was
to assess the applicability of novel ultrasound techniques for use in diagnostics of osteoporosis. The main aim (I.) of
this thesis work was to validate a novel dual frequency ultrasound (DFUS) technique for combined determination of soft
tissue composition and underlying bone properties by means of an in vivo case study. The DFUS method was further
developed towards use of single broadband ultrasound transducer. The second aim (II.) was to design a simple ultrasonic
in vivo methodology for determination of the thickness of the cortical bone layer.
Materials and methods:
I. In the first part of this study, the DFUS technique was applied to monitor the changes
in soft tissue composition and correction of the errors induced by soft tissues on the measurements of integrated
reflection coefficient (IRC). Measurements were conducted on a volunteer body builder during a 21 week training and
dieting period, inducing a weight loss of 16.5 kg (18%). For reference, dual energy X-ray absorptiometry (DXA)
measurements were conducted to follow the changes in soft tissue composition.
II. In the second part of this study, signal processing techniques for determination of cortical bone thickness were
first validated in vitro with six bovine samples. The in vivo measurements were conducted on 20 healthy volunteers. The
cortical thicknesses were determined from ultrasound signal with envelope and cepstral methods and compared to the
peripheral quantitative computed tomography (pQCT) and caliper measurements in vivo and in vitro, respectively. The
accuracy and precision of the ultrasound techniques were assessed.
Results:
I. The DXA measurements indicated that significant changes in quantity and composition of soft tissue,
but not in bone density, took place during the diet. As compared with DXA, the single transducer DFUS could determine
local soft tissue composition (r^2 = 0.88, n=8, p < 0.01). The change in uncorrected IRC associated significantly with the
change in body composition (r^2 = 0.56, n=8, p < 0.05). The IRC values, corrected by DFUS, showed only minor variation (SD
= ±1.26 dB) during the diet.
II. Values of cortical thickness, as determined with both techniques, showed high linear
correlations (r >= 0.95) with the thickness values obtained from in vitro measurements with a caliper or in vivo
measurements by pQCT. No systematic errors that could be related to cortical thickness were found. The in vivo accuracy
of the measurements was 6.6% and 7.0% for envelope and cepstral methods, respectively. Further, the in vivo precision for
the envelope and cepstral methods were 0.26 mm and 0.28 mm, respectively.
Conclusions: Both of these studies were conducted with the main aim of developing a new approach for pulse-echo
based ultrasound diagnostics of osteoporosis. The novel ultrasound techniques were further developed and validated with
two separate in vivo studies. These techniques may enable reliable assessment of both, trabecular and cortical bone
properties in addition to the determination of the composition of the soft tissue. As verified by this study, simple
ultrasound measurement method represents an accurate and feasible means for clinical estimation of cortical bone
thickness. Moreover, the DFUS method showed clear potential in the determination of soft tissue composition and therefore
could provide a solution for correction of the ultrasound parameters. A combination of these ultrasound techniques could
provide a novel approach for multi-site osteoporosis diagnostics using pulse-echo ultrasound. Overall, the techniques
presented in this thesis may have significant clinical value. The data gathered during this study will be published in
two international peer reviewed papers.
MRI relaxometry of the human brain in vivo at 1.5 T, 3 T, and 4 T
Laurila Maija, Tampereen teknillinen yliopisto
Magnetic resonance imaging (MRI) is a non-invasive, non-ionizing fast developing medical imaging method used mainly for
imaging of soft tissue, such as brain. Image contrast depends mostly upon the largely variable relaxation properties of
the tissues. The relaxation time constants T1, T2 and T2* can be quantitatively calculated by the development of the
signal intensity. The field dependence of the relaxation times has been the interest of several studies. T1 increases
with the field strength because the share of the proteins capable of rotating at the Larmor frequency, and thus effective
in relaxation, decreases. Both T2 and T2* shorten with the field, which partly derives from water diffusion and molecular
exchange in the presence of gradient fields; but is also influenced by increasing field inhomogeneities at high
fields. Tissues' relaxation patterns can give information on the molecular basis of relaxation and thus on the structure
of the tissue on molecular level. However, no previous study has measured the field dependence of each T1, T2 and T2* in
the human brain in vivo using the same sequences, volunteers, and similar hardware.
In the present study, twelve healthy volunteers, aged between 23 and 54 years, were each measured at three field
strengths for the comparison of the relaxation times at different fields. The measurements were performed with Siemens
Avanto (1.5 T); Siemens Trio (3 T); and Siemens/Bruker MedSpec (4 T). The three scanners had nearly identical software
and hardware, and the only significant difference was the field strength. At 1.5 T and 3 T a body coil was used for
signal transmit, and a 12-channel phased-array head coil for signal reception. At 4 T a head coil was used for both
transmit and receive: a birdcage coil for transmission, and an 8-channel phased-array coil for reception. The relaxation
times were measured with the TAPIR (T1 mApping with Partial Inversion Recovery), QUTE (QUantitative T2* imagE), and SE-MC
(Spin Echo Multi Contrast) sequences at each field.
Each T1, T2 and T2* showed the expected field dependence. T1 increased in selected anatomical structures in the basal
ganglia in white matter (WM) by 21-29% from 1.5 T to 3 T, and in grey matter (GM) by 15-17%. The respective changes from
1.5 T to 4 T were 22-43% and 21-30%. Segmentation of the WM and GM of the whole brain gave an increase of T1 from 1.5 T
to 3 T of 26% in WM and 16% in GM; and from 1.5 T to 4 T 38% in WM and 26% in GM. In iron-poor structures T2* at 3 T was
69-72% and at 4 T 55-62% of its values at 1.5 T; in iron-rich areas the respective T2* decreases were down to 58–65% and
45-52%. T2 decreased considerably less: in iron-poor structures T2 was 91-99% at 3 T and 81-95% at 4 T; and in iron-rich
structures 80-85% at 3 T and 67–72% at 4 T of its values at 1.5 T.
The study gave information on H2O relaxation dispersion in vivo. The T1 contrast was WM-GM specific, whereas T2 and T2*
contrast was more dependent on non-haeme iron concentration. The T2* shortening was accompanied with the strongest T2
shortening in putamen and globus pallidus. In these structures the transverse relaxation is significantly enhanced by
ferritin. All three relaxation maps gained sharpness and signal-to-noise ratio at high fields, but the gain in contrast
was mainly limited to T2 and T2*. More than three fields would still be needed to verify the form of B0 dependence of the
relaxation times in vivo, and the study should be extended to abnormal tissue.
Marjojen flavonoidien analysointi plasmasta HPLC-SI-MSMS-menetelmällä
Lehtonen Henna-Maria, Turun yliopisto
Marjat ovat pieniä pyöreitä pohjoisilla leveysasteilla menestyviä hedelmiä, joiden terveellisyys on yleisesti tunnustettu
jo pitkään. Kiinnostus marjojen terveyttä edistävien yhdisteiden sekä monien sairauksien välisiin vuorovaikutuksiin on
noussut nykyisiin mittoihinsa kuitenkin vasta viime vuosina. Eräs terveyttä edistävien yhdisteiden ryhmä on flavonoidit,
joita esiintyy marjoissa huomattavia määriä. Marjojen flavonoidit toimivat sekä antioksidantteina että eri sairauksiin
johtavien reaktioteiden säätelytekijöinä. Flavonoidien terveysvaikutuksia on tutkittu runsaasti mm. soluviljelmissä ja
niiden on todettu vähentävän esimerkiksi syövän sekä sydän- ja verisuonitautien riskiä, ja hillitsevän
tulehdusreaktioita. Flavonoidien terveysvaikutusten kokonaisvaltainen ymmärtäminen vaatii kuitenkin niiden imeytymisen ja
reaktiivisuuden tutkimista suoraan ihmiselimistössä. Tämän erikoistyön tavoitteena oli kehittää herkkä ja selektiivinen
nestekromatografiaan (HPLC) sekä tandemmassaspektrometriaan (MS/MS) perustuva menetelmä marjojen kuuden flavonoidien
analysoimiseksi verinäytteistä.
Erikoistyössä optimoitiin hydrolyysiin ja kiinteäfaasiuuttoon perustuva esikäsittelymenelmä sekä HPLC- ja
MS/MS-menetelmät kuuden flavonoidin (isoramnetiini, kversetiini, myrisetiini, kemferoli, (+)-katekiini ja
(-)-epikatekiini) yhtäaikaiseksi analysoimiseksi plasmasta. Lisäksi analysoitiin plasmasta mainittujen flavonoidien
pitoisuudet neljästä pohjoisen marjasta koostuvan marja-annoksen nauttimisen jälkeen.
Isoramnetiinin, kversetiinin ja kemferolin kohdalla menetelmän herkkyys saatiin toivotulle tasolle. Näiden yhdisteiden
osalta menetelmä mahdollistaa kvantitatiivisen analysoinnin myös pienemmillä plasman flavonoidipitoisuuksilla kuin mitä
työssä käytettyjen suurehkon marjakerta-annoksen nauttimisen jälkeen otettujen näytteiden pitoisuudet
olivat. Myrisetiinin, katekiinin sekä epikatekiinin osalta määritysrajat jäivät kuitenkin liian korkealle johtuen lähinnä
niiden tandemmassaspektrometrisesta käyttäytymisestä. Plasman isoramnetiini- ja kversetiinipitoisuudet kasvoivat marjojen
syönnin seurauksena, mutta muiden flavonoidien kohdalla selvää eroa ei ollut havaittavissa.
Kemferolin kohdalla tämä johtunee sen rajallisesta esiintymisestä tutkittavissa marjoissa, muilla myrisetiinillä sekä
katekiineilla tarvittavan herkkyyden puuttumisesta.
Kaulavaltimon ultraäänikuvien sekä EKG- ja verenpainesignaalin ajastettu analyysi
Lipponen Jukka, Kuopion yliopisto
Opinnäytetyön tavoitteena oli, kehittää menetelmiä yhtä aikaa mitattujen EKG:n, verenpaineen ja kaulavaltimon
ultraäänikuvien analysointiin. Signaalit mahdollistivat barorefleksin herkkyyden määrittämisen ja verisuonen
elastisuuden määrittämisen. Valtimoiden elastisia indeksejä määrittämällä voidaan saada tietoa alkavista
verisuonten rappeumataudeista. Barorefleksin herkkyyttä kuvaavat indeksit antavat tietoa verenpaineen
säätelymekanismien toimivuudesta. Tutkimuksen tärkeimpiä tavoitteita oli tutkia elastisuuden vaikutusta
barorefleksiin. Menetelmät toteutettiin MATLAB:illa ja käytön helpottamiseksi ne koottiin käyttöliittymän alle.
Opinnäytetyössä käytettiin laajalti singaalianalyysin menetelmiä. Barorefleksin herkkyysindeksien laskemiseen
tarvittiin aikasarjojen spektrit sekä niiden välinen koherenssi. Spektri estimoitiin AR-mallin ja periodogrammin
avulla. Barorefleksien herkkyyttä kuvaavina indekseinä käytettiin spontaaneista vaihteluista laskettavia spektri-
sekä sekvenssimenetelmien antamia indeksejä. Kaulavaltimon ultraäänikuvista määritettiin kuvankäsittely
menetelmillä suonen seinämät, joista voitiin laskea suonen halkaisijan muutos. Suonen elastisuutta kuvaavina
indekseinä käytettiin Elastista moduulia ja beta-jäykkyysindeksiä.
Ohjelmalla analysoitiin kahden nuoren ja kahden iäkkäämpää diabetesta sairastavan koehenkilön mittaus
aineisto. Diabetesta sairastavien koehenkilöiden barorefleksin herkkyys oli selvästi heikentynyt nuoriin koehenkilöihin
verrattuna. Elastiset indeksit osoittivat myös nuorten koehenkilöiden verisuonten olevan selvästi elastisempia,
kuin diabeetikkojen.
Tulokset osoittivat menetelmien erottelevan vanhat diabeetikot ja nuoret koehenkilöt helposti joten kehitetyt
menetelmät ja ohjelma ovat jatkokäytössä Kuopion yliopistollisessa sairaalassa.
Guided wave ultrasound in the assessment of osteoporosis in elderly women
Määttä Mikko, Oulun yliopisto
The prevalence of osteoporosis has increased during last decades and it is causing considerable economical and social
costs. At present, osteoporosis is diagnosed by means of bone density measurements. However, this method is incapable of
assessing other factors affecting bone strength and fracture risk. Quantitative ultrasound (QUS) axial transmission is
proposed to be a suitable method to measure cortical parts of the long bones. Using a centre frequency low enough,
so-called Lamb waves can be excited. Lamb waves are guided waves which propagate throughout the cortical layer of the
long bone and their velocity is shown to associate to material and geometrical properties of bone.
The aim of this study was to investigate the relationships between guided wave tibial ultrasound, femoral geometry, and
femoral and spinal bone mineral density (BMD). We also investigated if the method used is able to differentiate
osteoporotic subjects from normal subjects.
A low-frequency (fc=200 kHz) axial transmission prototype was used to measure ultrasound velocity (V) in the
mid-tibia. Subjects were 98 elderly women (78-82 years). Femoral shaft diameter and medial and lateral femoral shaft
cortex thicknesses were measured from digital radiographs. BMD was measured at the proximal femur and at lumbar vertebrae
L1-L4 using dual energy x-ray absorptiometry (DXA).
Statistically significant, however weak, correlations were found between V and femoral shaft cortex thicknesses measured
from radiographs (r=0.20-0.23). V also correlated significantly with various bone mineral density and bone mineral
content parameters. The strongest correlation was observed between V and Ward's triangle BMD (r=0.40, p<0.001). When
comparing mean ultrasound velocities of normal and osteoporotic subjects, V was a significant discriminator of total
upper femur BMD.
This study showed that the axial ultrasound measured at the tibia reflected a significant, even if only a limited,
proportion of the DXA-based BMD and cortical bone thickness. The method is comparable to other QUS methods in terms of
characterizing hip and lumbar spine BMD and it might thus be suitable for skeletal status assessment. Improving the
reproducibility of ultrasound measurements from the present is expected to further enhance the capability of V in bone
characterization.
Nivelruston kollageenisäikeistön vaikutus T2-relaksaatioaikaan
Nissi Mikko, Kuopion yliopisto
Nivelrikko on vakava kansantauti, joka pitkälle edetessään tuottaa kipua potilaalle ja vie lopulta tämän
liikuntakyvyn. Nykyiset nivelrikon diagnoosimenetelmät ovat varsin epäherkkiä, erityisesti varhaisten nivelrikkomuutosten
havaitseminen on vaikeaa. Varhainen diagnoosi mahdollistaisi tehokkaamman hoidon, ja siksi uusien herkkien
diagnostiikkamenetelmien kehittäminen on tärkeää.
Tässä työssä selvitettiin nivelruston ominaisuuksia magneettikuvantamisen avulla. Magneettikuvantamisesta saatuja ruston
ominaisuuksia kuvaavia parametreja verrattiin vastaaviin polarisaatiomikroskopialla mitattuihin parametreihin.
Polarisaatiomikroskopia on hyvin tarkka referenssimenetelmä näytteen optisten ominaisuuksien, kuten säiekulman,
tutkimiseen, mutta ei sovellu kliiniseen tutkimukseen invasiivisuutensa vuoksi.
Työssä tutkittiin rakenteeltaan ja kypsyysasteeltaan eli maturaatioltaan erilaista polvilumpion nivelrustokudosta. Osa
kudoksesta oli peräisin ihmisistä (n = 11), osa naudoista (n = 12) ja sioista (n = 11). Työn tuloksena havaittiin selvä
yhteys T2- relaksaatioaikojen ja ruston rakenteellisten ominaisuuksien välillä. Molemmilla menetelmillä havaittiin eri
kudoksissa yhtenevästi kolmen tyyppistä rakennetta: kolme-, viisi- ja seitsemänvyöhykkeistä rustoa. T2-kuvantamisen ja
polarisaatiomikroskopian avulla määritettyjen rustokudoksen histologisten vyöhykkeiden rajojen välinen korrelaatio oli
hyvä (r = 0.952). Lajien välisiä eroja tutkittiin rakenteeltaan samankaltaisissa ruston osissa. Eroja havaittiin lähinnä
ihmiskudoksen ja eläinkudoksen välillä, joskin kollageenisäikeistön orientaatiokulmassa oli havaittavissa eroja myös sian
ja naudan välillä.
Tämän tutkimuksen tulosten mukaan T2:n avulla voidaan havaita nivelruston vyöhykerakenteen muutokset, jotka kertovat
kudoksen kehittymisestä ja ominaisuuksista. Koska T2-mittaus on sangen herkkä nivelruston rakenteellisille
ominaisuuksille, on se siten myös potentiaalinen menetelmä varhaiseen nivelrikkodiagnostiikkaan.
Verenkierrollisten ja sähköisten näköherätevasteiden kytkennän mallinnus samanaikaisista NIRS- ja
EEG-mittauksista
Näsi Tiina, Teknillinen korkeakoulu
Aivotoiminnan tutkiminen perustuu perinteisesti hermosolujen synnyttämän aivojen sähköisen toiminnan
mittaamiseen. Elektroenkefalografialla (EEG) voidaan esimerkiksi rekisteröidä aivotoiminnan synnyttämiä potentiaalieroja
pään pinnalta. Toisaalta on olemassa menetelmiä, joiden signaalit syntyvät aivojen verenkierrossa tapahtuvista
muutoksista. Näitä niin sanottuja hemodynaamisia muutoksia voidaan mitata esimerkiksi lähiinfrapunaspektroskopialla
(NIRS). Tämän työn tavoitteena oli yhdistää EEG- ja NIRSmittaukset, jolloin pystytään tutkimaan aivojen sähköisessä
toiminnassa ja hemodynamiikassa tapahtuvia samanaikaisia muutoksia. Lisäksi tavoitteena oli kehittää NIRS- ja
EEGsignaalien välille yksinkertainen malli, joka pyrkii kuvaamaan neurovaskulaarista kytkentää (NVK) eli hermosolujen
toiminnan ja hemodynaamisten muutosten välistä vuorovaikutusta aivoissa.
Työssä suunniteltiin ja toteutettiin samanaikainen NIRS/EEG-mittaus. Yhdeksältä koehenkilöltä mitattiin sähköisiä ja
hemodynaamisia herätevasteita käyttäen 2 Hz:n taajuudella välkkyvää shakkiruudukkoärsykettä, jonka kesto oli 3, 6 tai 12
s. Kutakin ärsykepituutta toistettiin kolmessa sarjassa yhteensä 21 kertaa. Mallinnuksessa käytettiin hyväksi lineaarista
mallia, jolla pyrittiin ennustamaan NIRS:n mittaama hemodynaaminen vaste lyhyemmän tai pidemmän ärsykkeen synnyttämän
vasteen avulla. Mallissa oletetaan, että vasteet ovat toisistaan riippumattomia ja summautuvia. Lineaarisen mallin
tuottamia hemodynaamisten vasteiden ennusteita verrattiin NIRS- ja EEG-signaalien välille kehitetyn NVK-mallin
ennusteisiin. NVK-malli toimii kuten lineaarinen malli paitsi, että ennustuksen apuna käytetään sähköisten
herätevasteiden integraalia aikaikkunassa 0-70 ms, jolloin ennustetut hemodynaamiset vasteet skaalautuvat aivojen
sähköisen aktiivisuuden mukaan.
NIRS- ja EEG-signaaleiden samanaikainen kerääminen onnistui hyvin kyseisessä koeasetelmassa. Joidenkin koehenkilöiden
kohdalla hemodynaamisia vasteita ei kuitenkaan nähty, mikä saattaa johtua ihon pinnassa tapahtuneista hemodynaamisista
muutoksista eli niin sanotuista pintailmiöistä. Sähköiset herätevasteet näkyivät kaikilla paitsi yhdellä koehenkilöllä.
NIRS- ja EEG-signaalien välinen malli toimi tyypillisiä hemodynaamisia muutoksia tuottaneille koehenkilöille ja antoi
pääsääntöisesti tavallista lineaarista mallia paremmat ennusteet.
Työn tulosten perusteella NIRS/EEG-yhdistelmämittauksia on helppo toteuttaa ja niiden käyttöä kannattaa jatkaa
tulevaisuudessa. NIRS-signaaleissa näkyvien pintailmiöiden poistamiseen tarvitaan kuitenkin hyviä menetelmiä, jotta
kaikkien koehenkilöiden mittaukset saataisiin onnistumaan. Tulosten perusteella NVK-mallien kehitystä kannattaa jatkaa
tulevaisuudessa.
Optimaaliset elektrodipaikat kasvojen EMG- ja EOG- mittauksiin
Nöjd Niina, Tampereen teknillinen yliopisto
Ihmiset, jotka kärsivät erilaisten sairauksien aiheuttamista motorisista häiriöistä, saattavat kokea tietokoneen
näppäimistön tai hiiren käytön hankalaksi. He tarvitsevat avustavia laitteita, jotka mahdollistavat tietokoneen käytön
ilman käsiä tai niiden toimivaa hienomotoriikkaa. Olemme olleet mukana projektissa "Wireless Technology and
Psychophysiological Computing" kehittämässä mittauspantaa, jolla on mahdollista havannoida otsalihasaktivaatioita ja
silmän liikkeitä. Tavoitteena on kehittää pantaa siten, että se soveltuisi tietokoneen käyttöliittymän ohjaukseen:
katseella voisi liikuttaa kursoria näytöllä ja jokin kasvolihassupistus voisi vastata klikkausta. Pantaan integroitu
langaton tiedonsiirto rajoittaa siinä olevien mittauskanavien määrää: fysiologinen signaali vaatii suuren
näytteistystaajuuden ja tiedonsiirron kaistakoko on rajallinen. Nykyisessä mittauspannassa on seitsemän
mittauselektrodia. Jotta vähäisellä elektrodimäärällä saataisiin hyvälaatuinen signaali sekä silmien liikkeistä että
lihasaktivaatioista, tulee elektrodien paikat otsalla suunnitella hyvin. Tämän työn päätarkoitus on mallintamalla
suunnitella optimaaliset elektrodipaikat silmän liikkeiden synnyttämän sähkökäyrän (EOG) ja lihassähkökäyrän (EMG)
mittaamiseen.
Työn teoriaosuudessa selvitettiin lihasaktivaation fysiologisia perusteita, silmien anatomiaa ja EMG:n ja EOG:n
syntyperiaatteet. Työssä perehdyttiin kehon sähköisten signaalien mittaamiseen, ja siihen, miten eri lähteistä aiheutuvat
signaalit voitaisiin signaalinkäsittelyllä, matemaattisilla metodeilla tai mittaustilanteessa erottaa
toisistaan. Mallinnuksessa hyödynnettiin anatomisesti realistista pään mallia, joka on ehkä tarkin tähän asti maailmassa
käytetty päämalli. Se muutettiin laitoksellamme kehitetyn ohjelmiston avulla kolmiulotteiseksi differenssimenetelmä (FDM)
-malliksi, ja mallin avulla simuloitiin supistuvista lihaksista aiheutuvaa lihassähkökäyrää ja EOG:ta
otsalla. Optimaalisiksi elektrodipaikoiksi valittiin otsalta kohdat, joissa signaali on vahvin ja erottelukykyinen eri
lihasten aktivaatioille tai joissa elektrodit ovat herkkiä havaitsemaan silmien liikkeet niillä katselukulmilla, joita
tietokoneen näyttöä katsellessa tarvitaan (± 20°). Käänteisratkaisulla yleensä pyritään määrittämään sähköiset lähteet,
jotka ovat aiheuttaneet pinnalla mitatun signaalin. Omassa tutkimuksessamme haimme käänteisratkaisun avulla aktiivista
lihasta (yhtä sähködipolia etsittiin) ja katseen suuntaa (yhteensä kahta dipolia molemmista silmistä
haettiin). Testasimme käänteisratkaisun toimivuutta pienimmän neliösumman menetelmällä. Lihasten simuloituihin
pintapotentiaaliarvoihin lisättiin kohinaa ja arvioitiin sen vaikutusta käänteisratkaisun tarkkuuteen lihaksen
paikannuksessa. Myös katseen suunnan määrityksessä syntyvää virhettä tarkasteltiin ja arvioitiin, kuinka paljon virhe
vaikuttaa ohjattavan kursorin paikkaan näytöllä.
Tässä tutkimuksessa löydettiin mittauselektrodeille optimaaliset paikat, joiden todettiin eroavan osittain nykyisen
mittauspantamme elektrodipaikoista: Vaakasuuntaisen katseen mittaamiseen elektrodien tulisi olla
ohimoilla. Pystysuuntaiselle katseelle elektrodien paikat tulisi olla nenänvarren yläosassa ja toisen hiusrajan
tuntumassa kulmakarvan yläpuolella. Otsalihasaktivaatiota (frontalis-lihas) mittaavien elektrodien tulisi olla
pystysuorassa toisen kulmakarvan päällä: toinen lähellä kulmakarvaa ja toinen ylempänä lähellä
hiusrajaa. Corrugator-lihasta (kulmakarvoja yhteen vetävä lihas) mittaavien elektrodien tulisi olla vaakasuorassa: toinen
nenänvarren yläosan päällä ja toinen kulmakarvan päällä. Corrugator-lihaksesta saatava signaali olisi mallimme mukaan
vahvempi, jos elektrodit sijoitettaisiin kyseisen lihaksen lihassäikeiden suuntaisesti, mutta parempi erottelukyky
frontalis- ja corrugator-lihaksessa syntyneiden signaalien välille saadaan tuloksiemme mukaisella elektrodiasettelulla,
joissa frontalis- ja corrugator-lihaksia mittavat elektrodiparit ovat likimain kohtisuorassa toisiinsa
nähden. Laskettujen käänteisratkaisujen pohjalta voidaan todeta, että pienimmän neliösumman menetelmä toimii heikosti,
kun sillä paikannetaan useampia kuin yhtä signaalin synnyttävää dipolilähdettä. Tämä johtuu siitä, että useampaa dipolia
paikannettaessa käänteisratkaisu hidastuu, ja jotta esimerkiksi katseen suuntaa voitaisiin seurata reaaliajassa, tulisi
paikannusmetelmän olla nopea. Pienimmän neliösumman menetelmällä saimme kuitenkin kohtalaisen tarkasti määritettyä
katseen suunnan: virheet olivat 5°:een luokkaa, mikä tarkoittaa noin 4 cm:n osoittimen poikkeamaa tietokoneen näytöllä.
Jatkossa tulisi mittaamalla testata, että mallintamalla saadut elektrodipaikat todella tuottavat paremman signaalin kuin
elektrodipaikat, joita yleisesti on tavattu käyttää EOG:n tai kasvolihasten EMG:n mittauksissa. Mittauspantamme
mahdollistaa elektrodien käytön vain otsalla, joten esimerkiksi EOG-mittauksissa yleensä silmän alla käytettävää
elektrodia ei voida hyödyntää. Mittauksin tulisi myös selvittää, kuinka pienet katseen suunnan muutokset EOG-signaalissa
näkyvät, jotta tiedettäisiin, millainen tarkkuus käänteisratkaisulla katseen suunnan määrityksessä on ylipäänsä
mahdollista saavuttaa. Tämän jälkeen tulisi erilaisia käänteisratkaisuja testata ja löytää ratkaisu, jolla katseen suunta
ja aktiivinen lihas saadaan mahdollisimman tarkasti ja reaaliaikaisesti paikannettua. Päämalli on erittäin tarkka ja
mahdollistaa useita jatkotutkimuksia ja pään signaalien mallintamista. Mallintamamme EOG-signaali vaikuttaa luotettavalta
mallilta, ja mallin toimivuus testataan vielä siten, että mallinnettua signaalia verrataan mitattuun signaaliin. Tulemme
kehittämään lihasaktivaation mallia vielä siten, että mittaamme EMG-dataa, testaamme erilaisia lähdemalleja lihakselle ja
vertaamme, millainen lähdemalli tuottaa reaalisimman simulaation signaalista. Anatomiseen malliin perustuvia EOG- ja EMG-
mallinnuksia ei juurikaan ole maailmalla vielä tehty. Näitä signaaleja tullaan tulevaisuudessa hyödyntämään yhä enemmän
mm. autoilijan väsymistä tarkkailtaessa (EOG) ja lääketieteessä anestesian syvyyden mittaamisessa (kasvojen EMG). Siten
kyseisten signaalien tunteminen ja tutkiminen on tärkeää jatkossakin.
Resolution study of transcranial optoacoustic imaging of veins - a modelling study
Pulkkinen Aki, Kuopion Yliopisto
Optoacoustics is the study of sound generated by the absorption of light. Optoacoustical imaging is a method which
combines the contrast of optical imaging to the spatial resolution of ultrasound. Goals of this work are to develop an
inhomogeneous computation model to describe the optoacoustical phenomena in human tissue, and to use this model to
investigate the feasibility of optoacoustics to transcranial imaging of veins.
The developed two-dimensional computation model uses the finite element method (FEM) and the finitedifference timedomain
(FDTD) method. FEM is used to solve the radiative transfer equation describing the optical part of the problem and FDTD
is used to solve the optoacoustical waveequation describing the acoustical part of the problem. The model is used in a
geometry representing the back of the head. The effects of varying multiple parameters describing the problem are
investigated based on the acoustical output of the computation model.
Typical peak amplitudes of the acoustical signal emitting from the vein are found to vary between 2544 kPa as a function
of blood oxygen saturation (SO2). The peak amplitude of the whole signal is found to be in the order of 930 kPa. Hence
the signal to noise ratio (SNR) is between 2.7-4.7 %. In order to detect at least 10 % variations in the SO2 the measuring
system should have noise levels less that 0.2 %.
Based on the simulations of this work it is concluded that the transcranial imaging of veins via optoacoustics is very
difficult, if not even impossible due to the tough requirements laid on the accuracy of the measuring system.
Integration of zigbee and rfid technologies into hospital environment
Sliz Rafal, Oulun Yliopisto
Patient management in critical care is a highly dynamic and complex process because the state of the patient, therapeutic
goals and therapeutic actions change over time. The need for better quality of service, unique identification of health
records, and efficient monitoring and administration of patient, personnel and equipment require an extensive assistance
from software and identification technology domains. Previous efforts to improve hospital workflow have been focused on
implementing electronic medical records and patient identification separately. This effort addresses a concept of merging
wireless transmission technology and positive patient identification. In addition, to confirm the usability of this
concept in hospital environments a prototype device (ID-Beacon) has been built. This concept is based on the
identification algorithm which does not allow the transfer of medical records without a patient identification. In
practice, only intended patient misidentification may occur. This solution clearly defines hospital procedures and
explicitly indicates the staff responsibilities - makes possible to identify the nurse responsible for healthcare of a
certain patient and track medical equipment. The developed prototype acquires data through medical device port RS232 but
the solution is intended to be implemented into the device itself and therefore work as an internal communication module.
The hardware of ID-Beacon prototype is based on the N120 platform that is composed of CC2430 - System on Chip (SoC) made
by Texas Instruments. The CC2430 combines in one Integrated Circuit (IC) the 2.4 GHz IEEE 802.15.4 radio transceiver and
an industry standard enhanced 8051 microprocessor. Furthermore, ID-Beacon encloses a RFID reader that is capable to read
Mifare 1K, Mifare 4K and UltraLight RFID tags. To achieve the maximum performance of the reader, the PCB antenna circuit
has been tuned to the operating frequency of 13.56 MHz. Used, ISO 14443A standard provides a consistent basis for
proximity coupling tags. The software element is mostly based on Nanostack, an IP-based wireless sensor networking
protocol solution. In addition to the default 6LoWPAN protocols, it also allows the composition of new protocol layer
combinations.
Tests performed show that an 802.15.4 radio transponder is definitely not sufficient enough to transfer data. The
developed prototype acquires data through RS232 port of personal medical devices with a speed of 19.2 kbps which is equal
to 40 packets per second of radio transmission. For a single device, the packet lost ratio is on a satisfactory level but
enlarged amounts of transmitting devices make the transmission unreliable and somewhat unacceptable even in small
hospital wards. The radio signal tests show that the range for a stable transmission is limited to 20 meters and in some
cases (i.e. transfer patient between hospital units) is not enough. Employment of IPv6 protocol allows the supervision of
personal medical monitoring devices from every internet-connected place around the world. The implemented RFID technology
allows the patient, personnel and equipment identification process to surpass the limitations of the bar code and other
identification technologies (line-of-sight not required, tag can withstand a harsh environment, multiple tag read/write,
etc.). Implementation of ISO14443 standard and passive tags do not allow to perform real-time tags tracking due to
limited readability range (5 cm).
This information system is an important step towards the creation of an electronic medical record that would enable an
efficient consolidation of multiple records. This system can definitely aid physicians to avoid patient's
misidentification and to get an accurate and timely picture of a patient's condition. For example, ID-Beacon allows each
ward to check the availability of beds remotely without physically inspecting the premises. However, the prototype device
is not yet efficient enough. It is still evident that more studies are needed and that some fields need to be improved
(i.e. transmission data rate and range). Also, to improve the prototype, other technologies should be implemented. In
conclusion, by merging the positive patient identification and wireless medical records transmission, ID-Beacon solution
opens up a new avenue for the implementation of wireless technologies in the hospital's units.
Estimating running performance from physiological data
Varanka Matti, Oulun yliopisto
Running performance can be assessed in a laboratory environment by running an exhausting maximal treadmill test while
wearing a gas analyser mask. This may not be a convenient method for a hobbyist runner, since he may not have access to
costly treadmill testing. Because of this, simple submaximal measurement methods are needed which can assess the daily
running performance reliably and do not depend on the laboratory environment.
In this work, a multiple linear regression model is created which can estimate the daily running performance as an
endurance time. Endurance time is defined as the time until exhaustion when the subject runs on the treadmill whose
speed is increased by half a kilometer per hour each minute. The initial speed is eight kilometers per hour. This test
measures the aerobic system, running economy, and neuromuscular properties. The model uses the Running Index developed by
Polar Electro Oy and mean RR interval while standing as the predictor variables.
The model can estimate the daily fitness level in this data set with a mean estimation error of ±6.5%, and the standard
estimate of the error is 77 seconds. The data contained measurements from 27 subjects whose endurance time varied from
665 to 1260 seconds. As a second step, the created model was used to estimate the daily running performances in a four
week training intervention. The performance of the model remained constant when the estimated values were compared to
interpolated endurance times. Also, in the majority of cases (18 of 27), the estimated fitness trends were similar to
the interpolated endurance times.
The model created can estimate the daily running performance fairly reliably by using variables obtained with a heart
rate meter and a running speed sensor. Also, long-term changes of the running performance can be assessed by fitting
trendlines to the daily fitness estimates.
Near-infrared spectroscopy in measuring changes of cerebral haemoglobin concentrations during natural sleep
Virtanen Jaako, Teknillinen korkeakoulu
Near-infrared spectroscopy (NIRS) shows promise as a relatively inexpensive, non-invasive medical imaging modality for
haemodynamic measurements. In this thesis NIRS is applied in a sleep study to assess its applicability for monitoring
haemodynamic changes in the brain during all-night sleep. Possible future applications of the technique include
monitoring the quality of sleep and diagnosing sleep apnea.
Concentration changes of cerebral oxygenated (HbO2) and deoxygenated haemoglobin (HbR) are estimated in a series of 30
all-night sleep measurements and compared to neurophysiologically determined sleep stages and arterial oxygen saturation
and pulse rate measured with a finger pulse oximeter. A method for removing motion artefacts from NIRS signals is
presented and applied.
Results show that haemoglobin concentration levels are on average lower in deep sleep than in rapid-eye-movement (REM)
sleep. Apneic sleep is found to be associated with a decrease in HbO2 and an increase in HbR concentrations, with
cerebral tissue taking longer to recover from the apnea-induced oxygen deficit than surface tissue.
The thesis shows that NIRS can be used in monitoring cerebral circulation during normal and apneic sleep. However, there
are still problems involved in long term NIRS sleep measurements, such as the stability of the NIRS signal over long
periods of time, and the effects of surface tissue haemodynamics on cerebral signals. Further research is also needed to
analyse the effect of apneic sleep on cerebral circulation.